设立于2005年，原名为“中国社会科学院金融实验室”。这是中国第一个兼跨社会科学和自然科学领域的国家级金融智库。其后，中国社科院依托经济学部，陆续设立了十余家以金融、经济政策研究为取向的智库型研究机构，其中包括2010年与上海市政府合作设立的“陆家嘴研究基地”。

2015年6月，中国社科院批准上述十余家智库型研究机构整合为“国家金融与发展实验室”（以下简称“实验室”）。

2015年11月10日，“中央全面深化改革领导小组”第十八次会议批准实验室为首批25家国家高端智库之一。

2016年始，实验室同若干省市政府密切合作，先后成立了上海金融与发展实验室、广州金羊金融研究院、实验室青岛基地、实验室成都基地、芜湖皖江金融科技研究院等机构，以上机构均为实验室在该地的研究基地。

实验室下设研究中心、院、所、基地、论坛等，广泛覆盖了国内外金融经济的主要领域，包括：国家资产负债表、中国债券论坛、财富管理、宏观金融、金融法律与金融监管、银行、支付清算、资本市场与上市公司、全球经济与金融、经济增长与金融发展、金融科技、消费金融、文化金融、保险、房地产金融、投融资、长三角一体化、大湾区经济发展、国际政治经济学、特殊资产、中国政府债务、中欧金融与经济发展等。