南海文化博物馆在建馆之初就确立了立足本地资源优势，服务高校转型发展，助力海洋强国建设大业的办馆目标，自觉地将地方文化资源的挖掘、整理和发挥与高校人才培养工作、国家海洋保护与开发事业紧密联系，开展了一系列卓有成效的地方特色文化传承保护与开发建设活动。经过几年的快速发展，南海文化博物馆已经逐渐创立并形成以海洋文化、历史文化、民族文化等优势资源文化为主体，兼顾海岛生态文化、红色文化和华侨文化的展宣新路，建馆特色鲜明，藏展价值彰显，与国家海洋强国战略、“一带一路”倡议的推进高度契合。当前，南海文化博物馆正继续遵循国家、地方和高校发展要求，主动强化地方优势文化的应用开发功能，为建设高质量品牌功能馆坚定发力。