针对阿拉善盟沙漠腹地地下水和湖水的水质、水源问题，本文分别研究了巴丹吉林沙漠、腾格里沙漠和乌兰布和沙漠的水质水源特征。巴丹吉林沙漠腹地地下水水质优良，地下水补给湖泊；沙漠地下水从东南部以碱金属-弱酸根离子为主逐渐演替为西北部以碱金属-强酸根离子为主，地下水水化学年际与季节变化较小；地下水流动方向由东南向西北。参考腾格里沙漠和乌兰布和沙漠的地下水水源水质特征，本文认为阿拉善沙漠地区地下水以潜水、承压水或泉水形式存在于自然界，沙漠地区赋存的深层地下水水质较好，以古地下水、少量降水及侧向径流补给为主，补给速率慢。