2020年以来，新冠肺炎疫情在全球的传播在一定程度上改变着世界政治经济格局，也对湄公河国家产生了较大冲击。加强区域卫生合作、提升卫生治理能力已成为当下湄公河国家的迫切需求。疫苗作为全球抗击新冠肺炎疫情最有效的武器，其分配却深受地缘政治、物流供应链和融资等多方面限制。中国秉持人类命运共同体理念，积极向湄公河国家提供疫苗，并协助其提升本土疫苗生产能力。随着澜湄合作机制不断推进，中国在湄公河地区卫生治理中展现出参与更深入、方式更丰富、行为体更多元的特征。在澜湄合作机制的引领下，湄公河地区卫生治理取得了明显进步，树立了抗疫合作新标杆，深化了跨境传染病联防联控，丰富了地区卫生合作内容。但在疫情与中美关系变化交织的背景下，湄公河地区卫生治理也面临新的挑战。