本文重点探讨制定《横琴粤澳深度合作区条例》过程中所遇到的三大问题：第一，《条例》应由谁制定，即制定主体的问题。从中央立法和地方立法两个层面，分析和论证《条例》的制定主体。第二，《条例》的制定应经过哪些必要路径或程序，即如何制定的问题。第三，《条例》的核心内容应体现合作区建设的哪些定位和发展目标，即制定什么内容的问题。