高职院校孵化器是在高职院校中组织创立的孵化基地，目的是培养师生的实践和创业能力，促进科研成果转化，推动初创企业的发展。目前，高职院校孵化器在孵化过程中遇到诸多问题，导致孵化能力大打折扣，如何提高高职院校孵化器的科研水平和孵化能力变得十分重要。本文以3所河南省高职院校为考察对象，从加强高职院校自身建设，加强高职院校与企业合作、校校合作方面探讨高职院校孵化器的功能，为提升高职院校孵化器孵化能力提供一些实际的建议，改善当前高职院校孵化器单一的孵化机制，具有一定的创新意义。