印度、巴基斯坦、伊朗三国的法律分属于普通法系和宗教法系。三国加入上合组织后，给上合组织的司法合作带来新的因素。在刑事司法方面，上合组织创始六国都具有大陆法和社会主义法传统，检察机关不但具有独立的地位，而且发挥着重要作用。但在印巴两国的普通法传统中，检察院并无重要地位，甚至没有独立建制；加之两国均为联邦制国家，在处理具体案件时中央无法完全代表地方，地方各州省之间的检察院设置和警检之间的关系又各有不同。伊朗的检察院虽然与中俄等国类似，检察院发挥着重要作用，但伊朗法律中的非世俗成分、警察部门的庞大规模和其与军队、安全部门之间的复杂关系，以及司法部门的最终地位等均与上合组织其他成员国有所不同。在三国加入之后，上合组织各国参与司法对口合作的部门应有一定调整，以适应更加复杂的法律环境。