发明专利是衡量技术创新的核心指标。本文利用穗沪合作申请的发明专利数据，从合作总体态势、合作主体、合作产业领域及合作区域四大方面对两市的技术合作情况进行了分析。结果发现：穗沪技术合作波动增长；企业在穗沪技术合作中占主导地位；高校技术合作网络更加广泛；穗沪技术合作覆盖九大战略性新兴产业，新材料是重点合作产业领域，新一代信息技术、生物、新能源汽车三大产业合作提速；数字经济已成为两市技术合作的核心领域；穗沪技术合作已形成黄埔、天河、青浦和浦东四大核心地区。目前穗沪技术合作程度较低，合作模式较单一，面向新质生产力的技术创新协同亟待加强，技术合作中的国际资源整合亟待加强。基于上述分析，本文从完善促进专利合作的制度安排、鼓励头部企业引领、加强产业协同创新、进一步发挥天河和黄埔的引领作用、借力上海以吸引更多全球优质创新资源等方面提出了广州深化与上海技术合作的对策建议。