建立健全农村人居环境长期因子观测体系是提升农村人居环境整治成效的重要驱动和保障。为解决我国长期以来农业农村领域基础数据底数不清、演变不查、趋势不明的问题，中国农业科学院系统谋划和推进国家农业农村长期因子综合观测工作。本文系统阐述了农村人居环境长期因子观测体系框架、观测内容、观测指标体系、观测技术体系等方面的研究进展；识别出长期因子观测重视度不够、资金投入不足、标准体系不健全、观测技术落后、专业人员缺乏、观测网络布局不完善、数据管理和共享机制不健全等问题；同时，提出健全制度保障和资金配套以及观测标准体系、加强科技支撑、进一步提升长期因子观测覆盖度、搭建智慧化观测数据管理平台、建立长效数据共享机制等对策建议。