党的十八大以来，云南省深入学习贯彻习近平总书记关于完善分配制度的重要论述，加快推进全省高校、科研院所和高层次人才薪酬制度改革，先后出台一系列激励高校科研院所收入分配的政策及细化措施。本文系统梳理了云南省高校科研院所薪酬改革的具体进展情况，并分别介绍了高校与科研院所完善内部考核分配的主要做法。在总结实践经验的基础上，本文提出了三项高校科研院所薪酬制度改革的经验启示：注重普惠保障与有效激励相结合、结合实际抢抓政策导向与机遇，以及突出自主分配不断完善内部管理配套制度。