本文采用定量和定性相结合的研究方法，围绕专科医院医保管理难点与问题，对典型案例进行了分析。结果显示专科患者诊疗难度大，医保支付政策不能完全适应专科医院特点，专科医院加强了医保管理体系建设、信息化建设和培训、病案质控、绩效考核、医疗服务质量控制和医院医保沟通反馈，但内部运营机制仍不能完全适应支付方式改革需求。因此本文提出医保医疗协同治理的政策建议，医保应完善专科病组核心要素管理与调整机制，医院应推动内部协同改革，加强沟通反馈，通过支付方式改革推动专科医院高质量发展。