党的二十届三中全会通过的《中共中央关于进一步全面深化改革、推进中国式现代化的决定》提出深化零基预算改革，2025年国务院政府工作报告提出“开展中央部门零基预算改革试点，支持地方深化零基预算改革”。这标志着零基预算进入实质性的改革阶段。当前，地方零基预算改革的进展如何，有哪些有价值的做法和启示，深化零基预算改革面临哪些难点和挑战，深化零基预算改革有哪些抓手，围绕这些问题，本报告在多地开展实地调研。结合调研了解的情况，本报告认为，中国当前深化零基预算改革所面临的挑战集中表现在四个方面：基层部门深化推进零基预算改革的挑战、财政支出刚性规定对零基预算改革理念的挑战、顶层设计亟待健全带来的零基预算执行挑战；部门利益协调调控形成的零基预算深化改革挑战。深化零基预算改革可考虑在五个方面着力：一是中央领导，改革联动，多部门、多政策工具协同；二是强化顶层设计，为地方深化零基预算改革扩围提供必要指引；三是加强零基预算改革与现行财政预算管理制度的有机衔接；四是完善成本效益分析，建立定额标准动态调整机制；五是充分调动地方、各部门的积极性，避免“一刀切”。