为落实首都城市战略定位、加速国际科技创新中心建设，迫切需要北京市大力推动“专精特新”中小企业的创新发展。本报告以中国境内A股上市公司中国家级专精特新“小巨人”企业数据为代表，测算了北京及其他省份专精特新“小巨人”企业的创新绩效，借助准自然实验法及调节效应模型探讨了政府研发补贴对专精特新“小巨人”企业研发绩效的政策效应及作用机制，得出以下结论：（1）北京市政府提高对专精特新“小巨人”企业的研发补贴金额，重视专业技术服务、信息技术服务等行业的科技发展，但与全国均值相比，研发补贴金额仍相对较低；（2）北京市专精特新“小巨人”企业创新绩效均值有所提升，位居全国前列，其中电气机械及器材制造业和计算机、通信和其他电子设备制造业是推动北京市中小企业创新发展的重要行业；（3）政府研发补贴政策对北京市专精特新“小巨人”企业创新绩效具有稳健的正向激励作用，且政策效应高于全国水平，但与成渝城市群和粤港澳大湾区相比还有一定的进步空间；（4）政府研发补贴政策能够通过降低企业融资成本、提高供应链效率、加快数字化转型和培育耐心资本等途径提升北京“专精特新”企业创新绩效。本报告进一步提出优化研发补贴政策体系、加强融通创新和产学研协同创新等政策建议。