2009年，秘鲁国内爆发印第安人保护家园、反对对自然资源过度开发的抗议活动。政府与印第安人谈判破裂，冲突升级并造成伤亡。加西亚总统被迫更换部长会议主席并改组内阁。受国际金融危机影响，经济增长率由2008年的9.8%降至0.8%。由于政府采取产业调整、财政刺激等措施，从2009年第四季度起经济开始逐渐回升。有关社会指标未出现明显恶化，在减贫、教育等方面的社会政策继续得以实施。秘鲁十分重视发展与周边国家的合作关系，计划与巴西共同建设“大洋间通道”；与美国、欧盟、中国和日本的经贸关系进一步发展。