环境产权进行初始分配后，如果排污厂商拥有富余的许可证指标，就可以将这些富余指标拿到环境产权交易市场上交易。由于市场上不同的排污厂商在污染治理成本和收益等方面都存在差异，形成了供需关系，只要有足够多的参与者，通过市场交易和价格机制的作用，将促使边际污染治理成本低的排污厂商承担更多的污染治理任务，从而使社会总体污染治理成本降低，而边际污染治理成本高的排污厂商也通过购买排污权指标实现污染物排放尽快达标，这时环境资源通过环境产权交易市场实现了优化配置。