当前台湾已进入WTO，农村所面对的问题与半世纪前大不相同，此刻农会的角色与功能是如何协助农民克服加入WTO后面对之冲击，也就是如何提升台湾农业竞争力的问题。因此，长期而言，农会组织应转型，以协助农业部门提升农业竞争力为主要目标。