辽河流域是我国水资源最为短缺、水污染最严重的区域之一。为了对辽河流域进行水环境整治，需要探索制定出合理的生态补偿标准。本文在对现有流域生态补偿标准测算方法进行总结、分析的基础上，基于污染排放权的角度，采用机会成本和水资源价值相结合的方法，构建了一个流域生态补偿标准测算计量模型，并以辽河流域为例，对流经的主要城市的补偿标准进行实证测算，提出了可操作性强的流域补偿机制。最后，创新性地提出了混合式转移支付方式，为相关部门制定生态补偿机制提供决策依据。