在建立起了合作关系之后，双方便进入合作开展阶段了。首先，NGO要根据自身合作的目的，同时考虑对方的利益，精心设计项目。这些项目构成了NGO与政府合作的载体。项目设计的好坏往往决定了项目最终的成败。那么如何设计项目？案例中的措施可谓丰富多彩，包含了充分考虑政府的需求、项目设计紧跟政策形势、匹配资金形式多样化、资助形式多样化、灵活选择合作方式、选择合适的机构名称、游说政府官员、规避冲突、利用媒体资源、项目设计具有创新性、慎重选择项目点、联合其他NGO共同行动、针对某一行进行集中倡导等具体措施。