塞浦路斯共和国是国际民航《芝加哥公约》的签字国之一，也是联合国国际民航组织（ICAO）的成员国。此外，塞还是欧洲航空飞行安全组织的成员。加入欧盟后，塞执行欧盟的飞行惯例和指令。2000年，拉纳卡国际机场运送乘客4846330人次，货物42802吨，帕福斯国际机场运送乘客1384663人次，货物11357吨。这两大机场与欧盟、中欧、东欧、中东和南非等地开辟了直航。

为了适应乘客和货运不断增加的需要，2000年，拉纳卡机场的跑道延长了300米，从而可以起降大型客机和运输机；改善了候机楼的设施，可以为旅客提供良好的出入境的相关手续服务。2001年，拥有先进设备的飞行控制塔和航站楼落成投入使用。帕福斯机场的候机楼和停机坪也完成扩建，新的飞行控制塔已投入使用。

塞浦路斯航空公司成立于1947年，翌年4月，塞浦路斯航空公司依靠3架达科塔飞机，开通了飞往欧洲和中东的6条航线。其后，客机和航线不断增加。到2000年，航空公司拥有4架“空中客车”A310客机和10架A320客机，职员2000人。塞浦路斯航空公司已建立了飞往欧洲大陆、中东和海湾地区的30条航线，对于塞旅游业和经济的发展发挥了重要作用，并成为塞浦路斯与国外交流的一个重要桥梁。

2008年11月，帕福斯新机场建成并投入使用，运送旅客能力由年190万人次提高到年270万人次。拉纳卡新机场也于2009年底建成投入使用，届时运送旅客能力将由年510万人次提高到年750万人次。