上海市地处长江和太湖流域下游，河湖众多、水网密布，水资源量丰富，但本地河网水质普遍较差，水功能区达标率低，面临着严重的水质性缺水问题，最为典型的例证就是近百年来上海市水源地由于水质恶化而不得不数次搬迁，由苏州河迁到黄浦江，由黄浦江下游转移到上游。从上海市主要河湖黄浦江、苏州河和淀山湖的水质变化分析可知，随着上海快速工业化、城镇化进程，随着人口的大量增加，上海市水体水质主要呈现恶化趋势。直到20世纪90年代，上海市政府加大水环境综合治理力度，这种恶化趋势才得以遏制。但由于历史上污染过多积累、现状排污量大且污水处理标准偏低、城市面源污染严重，加之太湖流域上游省界地区来水水质较差，在短期内上海市水体水质难以明显改观。