新疆维吾尔自治区社会科学院苗普生研究员主持完成的国家社会科学基金项目《新疆民族关系史》（批准号为99BMZ015），最终成果为同名专著。

新疆自古以来就是一个多民族地区。千百年来，各族人民在开发、建设和保卫祖国边疆和共同的生产、生活过程中，互相依存，互相促进，共同发展，推动了新疆的社会进步。同时，他们之间不可避免地发生接触，并建立多方面的联系，进而发生混杂、同化和融合。各族人民在互相联系、接触的过程中，有交流，互惠互利，甚至同化和融合；也有矛盾和冲突，甚至战争。正确阐明历史上的新疆民族关系，不仅具有重要的学术价值，而且对于提高人们加强民族团结、维护祖国统一的自觉性，具有重要的现实意义。