直到今天，艾滋病防治教育仍然面临挑战。一方面，政府举办的性健康教育多为活动式宣传，缺乏系统性；而学校开展性健康教育在正规教育体制中形同虚设。另一方面，家长对性健康教育遮遮掩掩，社会公开讨论性及性健康教育的环境还未形成。早期进行艾滋病防治教育更是难上加难，民间投入更少。大多数教育类公益组织主要关注我国儿童和青少年“吃饱穿暖，上得起学”等普遍被关注的需求，而发展性的需求，已成为新时期儿童和青少年紧迫的社会需求却少被关注，尤其是性健康教育。这类少被关注的社会问题具有挑战性，政府和市场解决不了，留给公益领域解决，这就需要公益领域有比政府和市场更为创新的思维去寻找解决方案。可以说，对这类问题的关注具有敏感性和前瞻性，既需要探索精神，也需要耐心，不可急于求成，需要投入大量时间、精力和智慧。艾滋病防治教育可谓一场全民教育的社会工程，是超前的社会实验。