中国（上海）自由贸易合作试验区已经成功运作，广东省也在酝酿和申建粤港澳自由贸易区。粤港澳合作区与上海自贸区将是我国打造改革开放升级版的两大引擎，但在功能定位、法律基础、制度创新等方面存在明显差异。对这3方面的差异进行详细深入比较，可以对粤港澳自贸区的建设有更深入全面的理解，为相关政策和立法提供参考。