乡镇政权借公司下乡契机，控制村级“两委”；村级“两委”间围绕权力、利益争夺，矛盾激化，致使乡镇权力介入；土地流转中乡镇政权一手包办，村级“两委”与村民被边缘化；乡镇政权垄断相关信息，村级“两委”地位被动。这种反弹的行政化乡村关系与现代国家建构相背离。为此，在公司下乡中，需要明确乡镇政权的职责范围，规范其行为；加强村级“两委”组织建设，提高村级“两委”财权，协调村级“两委”矛盾；完善土地流转相关法律法规，提高村级“两委”地位，保障村民权利；加强企业与村级“两委”的直接沟通与谈判。

乡村关系体现着国家与社会的关系，事关国家稳定大局，影响我国基层自治民主的发展，公司下乡为现代农业的发展带来了资金与技术，与现代国家的发展趋势相适应。然而，笔者在调研过程中发现，公司下乡使得乡村关系向行政化方向反弹，伴随公司下乡的是乡镇政权的下沉，乡镇政府企图控制村级“两委”，从而更好地谋求利益，这在公司下乡的整个过程中都有所体现。为此，在公司下乡中，需要健全相关法律法规，规范乡镇政府行为，保障村级“两委”权利，使乡村关系朝着有利于现代国家建构的方向发展。