近代自然科学成果被介绍到中国之后，中国学者将其视为对中国传统思想资源具有特别功能和特殊价值的学术研究方法。通过对“科学”作为学术研究方法意识的形成和“科学”在中国传统哲学研究中的应用两方面进行深入分析，我们发现，科学认知范式在开掘中国传统哲学资源中的科学价值、建立新的学科、推动中国传统哲学转型等方面都具有积极意义，但对中国传统哲学中的人文精神可能产生消极影响。