1982年，兵团恢复，定名为“新疆生产建设兵团”，不再属于新疆军区管辖，生产经营的性质更加突出。

兵团恢复时，正值我国农村改革进行得如火如荼的时候，兵团所处的环境已经发生改变，兵团也开始改革，其内部机制发生了很大变化，决策、信息、激励—约束机制都出现了不同于以前的特点。