在综合分析已有研究成果的基础上，对流域生态补偿标准及模型进行对比分析，将流域生态补偿标准核算方法分为基于环境保护效益的流域生态补偿核算，基于生态保护成本、水污染治理成本及水污染损失赔偿的流域生态补偿标准核算，以及基于条件价值法的生态补偿标准核算。然后，通过对近几年国内应用的生态补偿标准核算模型进行总结对比，认识到将流域水体行政区界河流水质和水量指标设定为生态补偿测算的综合指标值，将有力地推进我国流域生态补偿制度的实施。