２００９年，《国务院关于支持福建省加快建设海峡西岸经济区的若干意见》中进一步明确要求完善闽江、九龙江、敖江、汀江流域上下游生态补偿机制，以利用经济杠杆，推动全省重点流域水环境综合整治工作，促进跨行政区域的流域生态环境保护，以加快福建省生态文明建设，增强流域可持续发展能力。