区域创新体系是国家创新体系的重要组成部分。推进杭州都市圈跨区域科技创新体系建设是杭州都市圈建设的重要内容之一。科技先行，有助于推进产业、经济的融合发展。本文强调了建设跨区域科技创新体系的关键因素和重要性，分析了跨区域科技创新体系的发展现状和存在问题，在此基础上提出了杭州都市圈跨区域科技创新体系建设的总体思路、原则和主要任务，最后从交流机制、规划纲要、项目合作、资源共享、人才合作等角度提出了对策建议。