本文通过对精英互嵌、组织协调与自主治理等相关理论脉络的梳理与分析，构建农村自主治理何以有效的理论框架，通过对西南S村成功自主治理案例的分析，进一步验证这一理论框架。研究发现，乡村社会中的政治精英与民间精英进行“互嵌”式合作，能够降低组织协调成本，合理协调和分配稀缺性资源，从而实现有效的农村自主治理。本文提出了在威权体制下政治精英与民间精英合作治理、国家与社会合作治理的具有中国特色的自主治理理论。