在广州创建综合性国家科学中心的背景下，各类科研机构作为城市的创新“智源”对城市的创新发展起着重要的支撑和引领作用。本文基于广州市主要科研机构（包括科研院所、高等院校中的重点科研机构和企业研发部门等）的类别、空间分布和成立时间，识别广州市科研机构集聚区，梳理其空间演变历程及分布，并进一步分析各集聚区内空间构成特征。研究发现，目前广州市已形成了五山、黄花岗、科学城等六个科研机构集聚区，这些集聚区与广州的城市空间同步发展，但与广州创新平台的空间耦合度有待进一步提升；现有的集聚区存在整体空间破碎、增量空间不足和空间资源配置不合理等问题，不利于科研机构的进一步集聚和创新网络的构建，并在此基础上提出通过优化增量空间建设开发模式、实行存量空间资源整合和再开发策略等措施，引导广州科研机构集聚区的高质量可持续发展。