结合治理理论、国家治理现代化的相关理论和专家学者对政府治理理论的论述可以发现，政府治理理论主要研究和关注两对相互交融的问题：第一对是政府治理体制（体系）和政府治理能力，第二对是政府治理评估和政府治理现代化。其中，第一对是第二对的基础和前提，第二对是促进第一对更加完善、有效的手段和目标。在第一对关系中，政府治理体制是政府治理能力的载体，在第二对关系中，科学的政府治理评估有利于指导政府治理现代化向着正确的方向推进