中国—东盟自由贸易区是双边关系发展到一定阶段的产物，但同时又表达了双方的某种超越经济利益的诉求。自由贸易区的框架安排说明其是一个渐进性的综合安排，其妥协因素将会影响自由贸易区效果的迅速释放。总体来看，自由贸易区建成将会促进双边贸易，但其对于双边关系的促进作用或许将不如开始阶段。从目前来看，尽管短期内双方在自由贸易区框架下的合作将集中在落实有关协议上，但长期来看自由贸易区建设必将使双方经济走上深度一体化的轨道。