沧源佤族自治县主要流行佛教（南传上座部）和基督教两种宗教，其余可归为民间信仰。据说，佛教（南传上座部）是在明代永乐五年（1407年）由麓川地区（今德宏地区）传入沧源的。而基督教则是在1918年前后，由美籍英国人永伟里、永伟生等人从缅甸传入沧源的，属浸信教会。目前，沧源县有佛教协会、基督教三自爱国运动委员会和基督教协会，均成立于2004年12月29日。