韩国华侨协会是一个较特殊的华侨组织，它有着自己特殊的历史，它的前身是“南韩自治总会”。日本投降，韩国光复之后，“中华民国”驻汉城总领馆也得以复馆，在总领馆的推动下，韩国华侨将“中华民国”地方自治组织搬到韩国，在韩国成立了48个自治区，每个自治区设有一个区公所，自治区内推行保甲制，十户为一甲，十甲为一保，若干保组成一个区，在汉城设自治总会统一管辖自治区事务，各甲、各保和各区都由华侨自己选举出甲长、保长和区长，负责推行基层自治管理和公共事务。韩国战争期间，华侨自治总会与华侨总商会合并，办理华侨事务，区公所改为自治区。战争结束后，一些战时的自治组织统一改组为华侨自治联合总会，下辖45个自治区、仁川自治会和济州岛自治会，这样也就实现了韩国华侨自治组织的统一。华侨自治联合总会及其下辖自治区统一改组为华侨协会和各地方华侨协会，负责管理各地华侨事务。中韩建交之后，为统一管理老华侨和新侨民事务，成立韩国侨民协会，各地华侨协会在中国大使馆登记注册。华侨协会组织结构包括侨民代表大会、理事会、监事会和常务理事会。

侨民代表大会由按照常务理事会提出的代表产生办法而推选出来的侨民代表构成，每年召开一次大会，代表大会选举出理事会和监事会，任期两年，理事会全体理事推选常务理事，组成常务理事会，常务理事会推举会长一名、副会长若干名。按照以往的协会章程，常务理事会每月需要开一次会，理事会和监事会每半年开一次会。

目前，韩国华侨的原自治区或自治会议改组为地方华侨协会，各地华侨协会的组织结构都是统一的，华侨协会的最重要功能就是负责华侨的户籍登记和管理，仍类似于地方自治组织。由华侨协会出具的户籍誊本具有证明华侨身份的法律效力，韩国公共管理部门和中国台湾代表处都予以承认。华侨户籍登记和管理的程序和方法，基本延续了“中华民国”时期的户籍管理体制，户籍管理内容包括详细记录华侨的户口及各种变更事项，如结婚、出生、死亡、迁移以及犯罪记录等。华侨协会的另一项重要功能就是辅助华侨教育事业和社会福利事业。各地华侨协会的经费来源主要是协会成员的会费和户籍誊本的手续费，有些华侨协会还通过房产出租获得一定收入，此外，部分经费来自侨领和其他人士的捐助。华侨协会的主要开支就是办公室秘书和户籍管理人员的工资报酬，以及水电费、电话费等办公费用和活动经费。从目前的收支情况来看，地方华侨协会都面临着经费短缺问题。协会的收入一般都难以维持办公人员的工资报酬，至于活动经费就更紧张了。

华侨协会组织最重要的活动就是侨民代表大会，在大会期间，侨民不仅可以讨论公共事务，谋求华侨的共同利益，同时也是增进华侨之间团结和联系的一次重要机会。此外，侨民大会还负责选举协会的组织领导班子，以带领侨民管理自己的事务。

华侨协会作为一种自治组织，与政府有着特殊的关系，因而它也是侨民与政府之间沟通和联系的桥梁。华侨的利益需求和意见通常可以通过协会反映到政府部门，而政府的意见也会通过华侨协会来实施。