2008年3月15日，十一届全国人大一次会议第五次全体会议表决通过关于批准国务院机构改革方案的决定草案，新时期以来的第六次国务院机构改革拉开序幕。在医疗卫生系统，国家食品药品监督管理局改由卫生部管理。大部制向各级部门提出了更高的要求，被视为通过改变政府部门组织形态消除相关弊端的良方。