农业综合开发之所以能取得令人满意的效果，其经验可以概括为在资金筹措和使用、开发的内容、项目选择、开发目标、开发模式等方面的创新。农业综合开发的理论意义可以概括为：为转型经济中政府对农业的支持和保护，探索了一种行之有效的方式；较好地解决了农业发展中公共物品的供给问题；调动不同利益主体增加农业投入的积极性；促进由传统农业向现代农业的转变；激发不同经济主体对农业综合开发的积极参与；找到了一条适合发展中国家特点的农业可持续发展道路。我国农业发展开始进入新阶段后，农业综合开发的内容主要是：优化农业结构，提高农产品品质；增加农民收入；大力发展农产品加工和流通，积极推进农业产业一体化经营；进一步发挥我国农业的比较优势，提高农业的国际竞争力；推广应用适用农业技术和高新农业技术，提高开发项目的技术含量；实现农业的可持续发展。