塞浦路斯的宗教信仰因民族不同而不同。希腊族人信仰希腊东正教。塞浦路斯希腊东正教会设有圣主教公会（由5名在职的都主教组成，受大主教领导），下设1个大主教区，5个都主教区，有神职人员千余人，教堂600多座，修道院10多座，神学院1所，教徒40多万人。大主教府设在首都尼科西亚，大主教头衔仍延用拜占庭帝国时期的传统，即“新查士丁尼区兼全塞浦路斯大主教”。

土耳其族人信仰伊斯兰教逊尼派属哈乃斐教法学派。1985年“北塞”宪法第一条就明确规定，“北塞”是一个世俗的“国家”，没有国教，土耳其族人自由选择自己的宗教信仰。宗教领袖不参与政治，对政治也没有影响力。伊斯兰教教义，在中小学可以学习，但不强制。土耳其族人的婚礼也是更多地采取现代礼仪，而非传统的穆斯林习俗。许多土耳其族人在斋月斋戒，也参加周五的主麻日聚礼，但真正的宗教虔诚者不多，平时并不严格遵守宗教习俗。特别是土耳其族人并不严格遵守伊斯兰教禁酒的规定，而是尊崇地中海地区诸多民族饮酒的习惯。

马龙派教徒信仰东仪天主教的马龙派。亚美尼亚人宗教上属基督教亚美尼亚教会。