《“十二五”国家政务信息化工程建设规划》首次提出“全面健康保障信息化工程”，并将其作为国家重要信息系统建设内容。“全面健康保障信息化工程”的建设目标，按应用对象分为三个层次：在政务管理层面上实现相关部门信息共享和业务协同，提升医疗卫生事业行政监管水平；在业务应用层面提高突发公共卫生事件应对能力、重大疾病防控能力、卫生监督和公众健康保障能力；在公共服务层面促进医疗卫生公共服务均等化，提高基层医疗服务能力，满足人民群众多层次、多样化医疗卫生需求。