日本帝国主义发动的侵华战争给中国的高等教育事业造成了空前的劫难和极大的损害，为了保存中国文化教育的命脉，并使中国高等教育事业不因战事而中断，抗战期间华北、华东、华中、华南等地的高校纷纷内迁。在日军占领初期，除部分教会大学及迁入上海租界内的部分高校继续艰难办学外，华东、华中、华南等沦陷区内的高等教育事业几乎一片空白。日伪傀儡政权建立后，开始“恢复”高等教育，“恢复”或创办了一些高等院校。但总体说来，日伪统治时期无论是高等学校的数量、办学规模，还是高等学校师生的人数、教学的质量，均无法与抗日战争前相提并论。