拉美社会科学理事会十分重视对外交往与合作。近年来，理事会与世界各国、各地区研究机构和组织之间的友好关系得到了很大发展。

理事会在联合国教科文组织中享有咨询地位，是其正式承认的国际学术研究机构。联合国教科文组织委托理事会成立了一个研究拉美大学问题的工作小组，以便为教科文组织提供建议。理事会为此专门联络了工作小组中从事拉美教育研究的专家，为联合国教科文组织提供了一切必要的信息。理事会的会员也经常应邀出席联合国教科文组织举办的各种活动。教科文组织还为理事会的地区奖学金计划提供资助。

理事会与北欧一些基金会和政府机构的关系十分密切，并且得到了大量资助。瑞典国际发展署和挪威合作开发署是理事会最重要的合作伙伴。很多计划和项目都得到了这两个基金会的大力支持和赞助。此外，理事会还尽可能扩大资金来源，争取更多的资助。在它的努力下，加拿大和比利时的基金会也相继成为理事会科研计划的赞助者。

在对外学术交流方面，理事会与欧美一些研究机构建立联系，开展合作。比如，加拿大的科研机构参加了理事会两个工作小组的研究工作。在“拉美社会观察”计划中，理事会也与加拿大和巴西的一些机构签订了协议，由它们负责整理相关的信息。近年来，随着影响力的扩大，理事会还不断受到南方共同市场成员国政府、世界社会论坛、世界教育论坛的委托，组织一些学术研讨会。欧洲和北美地区的大学要求入会的申请也越来越多。

在南南合作方面，理事会制定了拉丁美洲、加勒比与非洲、亚洲学术交流南南计划，目的在于推动拉美和亚非地区社会科学工作者之间的交流与合作，鼓励学者从整个南半球的视角分析和研究社会和历史问题。该计划得到了墨西哥、巴西、古巴、哥伦比亚等国一些亚非问题研究中心的响应和支持。在这项计划的推动下，理事会与津巴布韦、塞内加尔、埃塞俄比亚等非洲国家的研究机构签订了合作协议。比利时、荷兰和西班牙的一些研究中心也为该计划的实施提供了帮助。

与“贫困比较研究计划”的合作也是理事会重要的学术交流活动之一。该计划由国际社会科学理事会（Consejo Internacional de Ciencias Sociales）于1992年建立，专门从事对发达国家和发展中国家贫困问题的比较和跨学科研究。秘书处设在挪威的卑尔根。双方的合作始于2002年，主要目的在于开展对拉美贫困问题的研究，举办专题讨论会，从学术的角度帮助拉美国家消除和减少贫困。两个机构的工作重点包括：建立一个拉美贫困问题的专家网络，促进拉美地区与非洲地区学者之间的交流，加强拉美国家的比较研究，将研究成果应用于实际的扶贫工作中，搜集贫困方面的最新科研成果以提供给各地的研究人员。研究对象起初以中美洲和加勒比国家为主，后来扩展到玻利维亚、巴拉圭和厄瓜多尔。这项合作计划的内容分为奖学金、国际研讨会和培训班3个部分。至今已在安提瓜和巴布达、尼加拉瓜、玻利维亚、巴西、古巴等国举办了多次国际研讨会。

拉美社科理事会与拉美地区另外一个重要的学术机构——拉丁美洲社会科学学院（FLACSO）保持着良好的合作关系，并从各自不同的侧重点和目标出发，在拉美社会科学研究领域互为补充，共同发挥着重要作用。拉美社科理事会的很多创建者和领导委员会成员都曾经在拉美社会科学学院或下属的研究中心接受过培训；而拉美社会科学学院的9个下属学术单位都是拉美社科理事会的会员，很多教学工作由理事会的研究人员承担。

在出版方面，理事会积极寻求合作者，扩大合作出版的途径，与阿根廷、墨西哥和巴西等国家的出版社和杂志社建立了长期合作关系。

拉美社科理事会与中国社会科学界的关系是近几年才建立并发展起来的。2003年中国学者应邀参加了理事会第21次代表大会和随后举办的第3届拉美和加勒比社会科学研讨会，并在大会上发言。此后，中国学者多次访问理事会执行秘书处。为促进学术交流与合作，拉美社科理事会与中国社会科学院签订了《框架合作协定》。2008年12月，拉美社科理事会执行秘书长埃米尔·萨德尔应中国社会科学院的邀请来华参加了“改革开放30周年国际学术研讨会”。