在具体的机构上，争端解决机构（DSB）由WTO全体成员方的代表组成，其创设于乌拉圭回合，意在解决WTO各项协定可能引发的争端。DSB有权设立专家组，通过专家组和上诉机构报告，并监督其通过的裁决和建议的执行，以及如果成员方未对其裁决和建议及时做出回应，其有权授权中止适用协定项下的减让和其他义务。DSB应“视需要召开会议，以行使其权能”。它通常每月召开一次会议，也可应某一成员方的请求召开特别会议。DSB以一致同意的方式做出决议，即如果DSB做出决议时，与会成员方无一正式表示反对，该决议即通过。

在争端解决程序上，GATT/WTO争端解决机制亦被称为“外交（政治）与司法，两条腿走路”。2007331在GATT时期，GATT 1947第22条规定的“协商”是指运用外交手段解决分歧；而第23条则规定，在协商无法解决时，由缔约方全体“调查”，“提出建议”，并于“适宜时做出裁决”。在WTO时期，DSU第4条和第5条中的磋商、调解与斡旋体现为争端解决的政治手段，而专家组和上诉机构裁决争议则体现为准司法性。当然，必须强调的是，DSU中的磋商、斡旋、调解等程序，是受WTO法律框架严格限制的，它与传统国际法中的漫无限制的纯外交方式有所不同，也与国际贸易领域中WTO以外的规范不同。