混合所有制企业党建工作既面临国有企业党建的一般性难题，又面临自身的特殊性难题，主要包括两类，一类是认识的差异性难题，另一类是实践的技术性难题。基于对混合所有制企业党建复杂条件的深刻认识，出于减少党建成本和提升党建质量的双重考虑，应将协商作为开展党的活动的首要工作，以此作为加强混合所有制企业党建的首要环节，努力通过沟通达成党建合作问题的解决。