作为中国新一轮改革“试验田”的上海自贸区将大力发展总部经济作为自贸区总体目标之一。上海自贸区将打造成跨国公司地区总部的“吸金石”。但上海自贸区发展总部经济的环境与成熟国际化城市还有相当的差距。因此，上海自贸区总部经济的发展应借力成熟市场和国际城市的经验才可实现高效、跨越式的发展。本文选取了地区总部选址的影响因素和标准，比较分析了上海自贸区和香港发展总部经济的现状、重要标准及关键性指标，针对存在的差距提出上海自贸区总部经济发展的实证性建议。