《农民专业合作社财务会计制度（试行）》为合作社的规范发展奠定了重要的理论基础与制度基础，但在执行的过程中涌现了不少的问题。本文通过研究分析合作社财务管理的特点，发现合作社在财务管理上普遍存在如下问题：财务制度本身的欠缺、财务管理软件开发与服务滞后、财务会计制度与税务部门对接不畅、合作社运营管理不规范、财务人员专业化程度不高。同时，提出完善合作社财务会计制度、税务系统与合作社会计报表对接、推广合作社财务软件的应用、规范合作社运营管理、加大合作社财务人员培训力度等建议。研究结果为合作社做好财务管理工作提供有益指导，以财务管理规范为基础促进合作社规范发展。