乡村振兴与农民合作社具有互动效应。但是在乡村振兴过程中，农民合作社发展会遇到诸多困境，譬如，发展理念滞后，资本下乡冲击，人才流失，政府职能转换跟不上实际需求。今后，要将农民合作社纳入乡村振兴战略，建立健全双方健康发展的体制和机制，还要防止乡村振兴和农民合作社发展进入误区。