清末，东三省将军对其临近蒙旗的治权逐级加强。从理藩院系统下盟旗体制到东三省将军体制核心治权的转变是一个长期的历史过程，而新政初期是其转移过程中比较关键的环节，体现在行政、司法等诸多方面。究其原因，一个重要因素即是代奏权的转移，即蒙旗的代奏权由理藩院转至东三省将军。