央地关系是国家治理体系的重要内容，央地权限的合理配置能够在突发公共卫生事件治理中发挥重要作用。中国突发公共卫生事件中的权力涉及疫情信息的流通与公开、疫区的划定与封锁、行政强制措施和监督管理，权限较为集中，且会随着事件具体发展情况在中央的主导下进行临时性调整。然而突发公共卫生事件中的权力较为集中不足以应对突发事件，同时地方主义也有所显现，整体的事权划分模式存在一定缺陷。对此，建议下放包括预警权在内的部分决策权力，规制突发公共卫生事件中的地方主义，并完善央地权限分配模式。