区域协同创新通过对资源的高效配置，提升创新效率、降低创新风险，是促进区域高质量一体化发展的必由之路。本文基于协同创新的理论与实践，构建了包括资源共享、创新合作、成果共用、产业联动和环境支撑五个方面的长三角区域协同创新指标体系，对长三角区域协同创新能力进行总体分析，并从中选择10个核心指标对长三角区域协同创新能力进行综合分析，旨在全面刻画长三角在资金、人才、平台、技术等方面的协同创新特征、趋势与薄弱环节。研究发现，各省市科技创新数据统计分割严重，统计口径存在差异；G60科创走廊与江苏的联动作用仍然有限；长三角各地优势力量的合力贡献仍然不够凸显。因此，为了战略性支撑长三角高质量一体化发展，应当完善长三角科技统计制度，构建区域数据敏捷治理机制；探索“G42”“沪苏”“沪通”同城科技战略，打造长三角“多极点”创新辐射枢纽；聚焦长三角重大技术联合攻关，建立“主体、能力、项目”一体的基础资源库。