世界各国的农牧业生态补偿制度都是在国家总体农牧业和农村发展政策框架内，与农牧业和农村发展政策保持了一致。实施生态补偿的目的主要是补偿（或避免）农牧业生产的正（负）外部性，补偿农牧民为改善环境而作出的努力，通过补偿转移社会财产给农牧民等。设置基准线、客观地计算补偿额度是确定补偿金额的基础。在发达国家，补偿资金主要来自于政府，在发展中国家，补偿资金来源则以跨国组织和基金会资助为主。通过生态补偿有效地保护了生态环境景观，但是，由于贫困家庭参与能力弱，缓解贫困的效果一般。